Exosome(外泌體)是活細胞分泌的來源于晚期核內體(也稱為多囊泡體)的膜性囊泡,存在于體液中,包括血液、唾液、尿液和母乳等。目前研究發現,exosome內含有與細胞來源相關的蛋白質、脂質和各類核酸分子,尤其是miRNA和lncRNA。Exosome能夠通過生物屏障,在細胞間傳遞功能性核酸分子,從而發揮各種生物學功能,有望成為一種新型給藥途徑及基因治療載體。
吉賽生物提供外泌體提取試劑盒,能夠快速分離提取exosome RNA進行建庫測序,滿足外泌體mRNA,lncRNA,circRNA,miRNA的不同研究需求。
技術路線
樣本要求
樣品類型:血清、血漿、尿液、或細胞上清液等
物種:人、大小鼠(特殊物種詳詢技術支持)
具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。
測序方案
分析對象:mRNA+lncRNA+circRNA
測序模式 PE150
測序數據量 10 Gb
分析對象:miRNA
測序模式 PE150
測序數據量 10 M reads
長鏈轉錄組分析內容
1 原始數據質控檢查
2 比對結果質控檢查
3 基于基因表達的樣品主成分分析
4 差異基因表達及相關通路富集分析
5 circRNA預測及鑒定
6 circRNA差異分析
7 差異circRNA宿主基因的通路富集分析
8 差異circRNA的靶向miRNA預測分析
9 長鏈非編碼RNA差異分析
10 基于基因表達的通路活性分析
11 轉錄調控活性分析及通路互作分析
12 差異長鏈非編碼RNA的調控基因的通路富集分析
13 circRNA及靶向miRNA網絡調控制圖
miRNA分析內容
1 miRNA測序分析
2 原始數據質控檢查
3 比對結果質控檢查
4 新miRNA預測
5 ncRNA注釋(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA / piRNA)
6 基于miRNA表達的樣品主成分分析
7 miRNA差異分析
8 差異miRNA靶基因GO功能分析
9 差異miRNA靶基因通路分析
10 差異miRNA與差異表達基因調控分析(如果有mRNA測序結果)