m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺苷）是真核生物中最常見最豐富的RNA修飾，作為一種可逆修飾，RNA既可以在甲基化轉移酶METTL3/14 等酶的作用下發生m6A甲基化修飾，又可以在FTO、ALKBH5等酶的作用下發生去甲基化修飾；另外，它能夠通過YTHDC1/2 等m6A 識別因子發揮重要功能，例如目前已發現 m6A 在調控基因表達、剪接、RNA編輯、RNA穩定性、控制mRNA壽命和降解、介導環狀RNA翻譯等方面扮演重要角色 。
circRNA 作為一類新的 RNA 分子，也被發現存在大量 m6A 修飾，并且與線性 RNA 共享相同的 Writers 和 Readers 但具有不同的表達模式。m6A 對 circRNA 的生命活動具有重要的調控功能，包括m6A 能夠介導 circRNA 的形成。
目前對m6A的轉錄組研究的主要方法為MeRIP-seq（methylated RNA immunoprecipitation sequencing），其原理是通過m6A特異性抗體識別并結合具有m6A修飾的RNA片段進行免疫共沉淀，對富集下來的RNA片段進行高通量測序。結合生物信息學分析，即可在全轉錄組范圍內對m6A修飾進行系統研究。
技術路線
樣品要求
樣品類型：細胞或組織，total RNA。
物種：哺乳動物細胞或組織（有參考基因組且注釋信息完整）
具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請咨詢技術支持。
測序方案
測序模式 PE150
測序數據量 12Gb raw data
生物信息分析流程
部分結果展示
RIP 富集分布分析
m6A 全基因組分布分析
m6A的元基因分析
m6A 特定基因豐度展示
KEGG通路富集分析
Motif分析
m6A和轉錄組關聯分析
經典案例
案例1
案例2
參考文獻
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