廣義的翻譯組指的是直接參與翻譯過程的所有元件，包括但不限于核糖體、正在翻譯的mRNA、調控性RNA、新生肽鏈及各種翻譯因子等；狹義的翻譯組特指正在翻譯的mRNA。核糖體印跡測序（ribosome profiling，或ribo-seq）是指對被核糖體保護的30nt左右的mRNA片段進行深度測序分析，是目前研究翻譯組學的主要技術手段之一。

技術路線

樣品要求

        樣品類型：細胞或組織裂解產物。

        物種：哺乳動物細胞或組織（有參考基因組且注釋信息完整）

        具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請咨詢技術支持。

測序方案

        測序模式 PE150

        測序數據量 20Gb raw data

案例展示

人類心臟翻譯組學研究

        The Translational Landscape of the Human Heart

        Cell (2019). DOI: 10.1016/j.cell.2019.05.010  IF：36.216

        測序策略：Ribo-seq & mRNA-seq

        樣本分組：80例心臟組織，65例心肌病，15例正常對照

圖2 Ribo profiling分析可翻譯的circRNA分子

Ribo-seq實驗及分析思路

Ribo-seq主要生信分析內容

        1. 原始數據

        2. 質量控制

        3. 序列長度選擇

        4. 比對到參考基因組

        5. Reads分布統計

        6. 翻譯/非翻譯uORFs特征分析

        7. TE翻譯效率分析

        8. 差異TE基因表達分析

        9. 差異TE基因聚類分析

        10. 差異TE基因GO/KEGG富集分析

        注：Ribo-seq的翻譯效率的分析需要結合RNA-seq的數據進行分析。

吉賽生物NGS樣本采集、保存、運輸要求（2020年version2.2）