宏基因組（Metagenome）是環境中全部微小生物遺傳物質的總和，它包含了可培養的和未可培養的微生物的基因組。宏基因組測序是指對微生物群體進行高通量測序，通過測序數據分析特定環境中微生物群體基因組成及功能，研究微生物多樣性、種群結構、生物進化與環境之間的關系，解讀微生物群體多樣性與豐度，微生物與宿主之間的關系，發掘和研究新的、具有特定功能的基因，挖掘具有應用價值的基因資源，應用于開發新的微生物活性物質。

技術路線

樣品要求

? 樣品類型：Meta樣品，如糞便、土壤等或Meta DNA樣品。

? 物種：常見有參微生物（詳詢技術支持）

?具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄二。

測序方案

測序模式 PE150

測序數據量 5-10Gb

生物信息分析內容

基礎分析  

1 物種組成和豐度統計；

2 樣品復雜度分析；

3 樣品間物種豐度差異分析；

4 基因組組裝；

5 基因組組分分析；

6 基因功能GO-COG注釋；

7 基因功能KOG，KEGG注釋；

高級分析 

8 多樣品顯著相關因子分析；

9 與疾病相關的基因的深度分析；

10 菌群共生關系網絡構建；
11 系統進化樹構建；

吉賽生物NGS樣本采集、保存、運輸要求（2020年version2.2）